朝妻城は、坂田郡新庄の国人・新庄直昌氏が築いたと考えられます。直昌の子直頼は浅井氏に属していましたが、のちに織田信長に降り、秀吉の馬廻りとなり、その子孫は常陸麻生藩主（茨城県行方市）として、明治まで大名家として存続しました。
新庄氏歴代の居城は、箕浦荘の新庄城ですが、朝妻は古代以来、湖上交通の要港である「朝妻湊」があり、浅井氏がここを支配するために、新庄氏に城を築かせ守護させたと考えられます。