八幡宮と隣り合わせに大きなお堂が建っています。もと八幡宮の神宮寺で、元亀・天正の兵火に遭いましたが、秀吉公の厚い保護を受け再興しました。明治の廃仏毀釈により舎那院を除く当時現存の六坊は廃寺となり、本尊愛染明王、薬師如来をはじめとする宝物は舎那院に移されました。
本堂には旧国会議事堂の扉が使われており、８月初旬から９月にかけて境内一面に「芙蓉」が咲きます。