かつて藤原不比等（ふじわらのふひと）の別荘地であった場所に、鎌倉中期、安楽精舎を建立したのが始まりで、仏智禅師によって開山されました。姉川合戦の折に焼失したものの、江戸初期に彦根藩主井伊直孝によって再建されました。
夢窓国師の作と伝えられる広大な庭園は、びわ湖を模した池を中心とした山水廻遊式鶴亀庭園です。また境内には、「遺命により当山に納む」と記録に残る「足利尊氏の爪墓」が現存しています。